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Idée reçue #5: "Les systèmes cell-free fournissent de faibles rendements d'expression"

Rédigé par Bruno Tillier | Jul 9, 2019 12:47:17 PM
En général, les systèmes cell-free sont associés à un faible rendement d’expression de protéines. Si cette idée était vraie dans les années 2000, ce n'est certainement plus le cas aujourd'hui (Carlson et al., 2012).  Ainsi nous pouvons dire que le système cell-free est aussi performant que les autres, et donne même de meilleurs résultats, dans certains cas, comme nous l’expliquons ci-dessous.

De meilleurs résultats que les systèmes E.Coli, notamment pour les protéines difficile à exprimer !


En effet, les rendements obtenus avec les systèmes cell-free sont encore plus élevés qu'avec les systèmes E. Coli, notamment pour les protéines difficiles à exprimer, comme les protéines membranaires, cytotoxiques ou encore instables.

Pour illustrer cela, des systèmes cell-free, complétés par des vésicules dérivées de membranes internes E. coli, ont été utilisés pour produire deux transporteurs à membranes intégrales complexes: la perméase de mannitol à six membranes (MtlA) et la pompe tétracycline à douze membranes (TetA), sans utiliser de détergents ou d’étapes de repliement des protéines.

Résultats ? : Les deux transporteurs d'E. Coli MtlA et TetA ont été produits à des rendements respectifs de 130 ± 30 µg/mL et 570 ± 50 µg/mL (Wuuu et al., 2008). Soit des rendements 60 à 400 fois plus élevés que ceux habituellement obtenus dans les systèmes cellulaires !

Ainsi, il est maintenant fréquent d’avoir des rendements d'expression en systèmes cell-free élevés (supérieurs à 0,5 g/L), et les meilleures résultats peuvent atteindre 2g/L et jusqu’à 100 g/L pour la valeur connue la plus haute ! Ces rendements d'expression élevés ont été obtenus grâce à  des systèmes d’expression cell-free utilisant un métabolisme optimisé, dotés d’une régénération énergétique améliorée et d’un recyclage des sous-produits. Par exemple, jusqu'à 1,7 g/L de chloramphénicol acétyltransférase et 2,3 g/L d'une protéine reporter deGFP ont été synthétisés à partir de maltodextrine ou de maltose pour recycler le phosphate inorganique et régénérer l'ATP (Kim et al, 2011 ; Cashera et al, 2013).

Source: Protéines « Thromboplastine » et  « Récepteur à la bradykinin 2 ». Système acellulaire Synthelis Vs. système cellulaire.Source: Protéine « Bak » Svetlana Nedelkina, Isa Gokce, Helen Ridley, Céline Weckerle, Thierry Magnin, François Vallette, Franc Pattus, Jeremy H. Lakey, Burkhard Bechinger , High-yield expression and purification of soluble forms of the anti-apoptotic Bcl-xL and Bcl-2 as TolAIII-fusion proteins, Elsevier, Protein Expression and Purification 60 (2008) 214–220.

 

Auteurs & sources:

Carlson E.D., Gan R., Hodgman C.E., Jewett M.C. 2012. Cell-free protein synthesis:Applications come of age. Biotechnology Advances 30:1185–1194.

Caschera F., Noireaux V. 2013. Synthesis of 2.3 mg/ml of protein with an all Escherichia Coli cell-free transcription-translation system. Biochimie 1-7.

Kim H.C., Kim T.W., Kim D.M. 2011. Prolonged production of proteins in a cell-free protein synthesis system using polymeric carbohydrates as an energy source. Process Biochem 46:1366–1369.

Li J., Lawton T.J., Kostecki J.S., Nisthal A., Fang J., Mayo S.L., Rosenzweig A.C., Jewett M.C. 2016. Cell-free protein synthesis enables high yielding synthesis of an active multicopper oxidase. Biotechnology Journal 11.

Wuu J.J., Swartz J.R. 2008. High yield cell-free production of integral membrane proteins without refolding or detergents. Biochimica y Biophysica Acta 1778 1237–1250.

Zawada J.F, Yin G., Steiner A.R., Yang J., Naresh A., Roy S.M., Gold D.S., Heinsohn H.G., Murray C.J. 2011. Microscale to manufacturing scale-up of cell-free cytokineproduction – A new approach for shortening protein production developmenttimelines. Biotechnology Bioeng 108(7):1570-1578.

François Vallette, Franc Pattus, Jeremy H. Lakey, Burkhard Bechinger , High-yield expression and purification of soluble forms ofthe anti-apoptotic Bcl-xL and Bcl-2 as TolAIII-fusion proteins, Elsevier, Protein Expression and Purification 60 (2008) 214–220.